NGS:Next Generation Sequencing

這次是由鄧老師來教我們認識NGS
這是由鄧老師所架設的網站可以用來分析NGS的DATA
DASP:Deep Sequencing Smallrna Analysis Pipeline
網址:http://dsap.cgu.edu.tw/

DEMO _LINK 點進去

可以再進一步去看更詳細的檔案

可以依照你的需求來做排列 如名字 或 表現量

 可以看跨物種的比較以及phylogenic分布

GO: the gene ontology

這是"GO"的網址:http://www.geneontology.org/
在下圖輸入你想找的gene

接下來我輸入CD44

選擇你的物種 Data來源

接下來按Browser

裡面有3個選項可以更進一步查詢: 分別是

biological

 Molecular

Cellular



STRING--->看protein-protein interaction

STRING 網頁:
http://string.embl.de/newstring_cgi/show_input_page.pl?UserId=OtTDdNLsOyOX&sessionId=XmR18k3OQNwf

填上protein的名字或是放上sequence，或是選擇多個protein也都可以使用

我查詢的是keratin 10
action view的model

protein之間有線，表示彼此間的關係

不同species之間同一個protein 的gene的演化相關性

                                                                                            

最後當然是把要的資料儲存起來

選一個你要的吧!!